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[Enciclopedia Online Gratuita] Diccionario de Internet y Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC):

ıllı Ontología Génica : que es, definición y significado, descargar videos y fotos.

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El proyecto Ontología Génica (en inglés Gene Ontology cuya inicial es GO) provee un léxico controlado que describe el gen y los atributos del producto génico en cualquier organismo. Puede ser, por norma general, dividido en 2 partes. La primera es la ontología por sí misma; realmente son 3 ontologías, cada quien representando un término clave en biología molecular: la función molecular de los productos génicos; su rol en los procesos biológicos de múltiples direcciones; y su ubicación en componentes celulares. Las ontologías son de forma continua actualizadas, y se dispone de nuevas versiones mensualmente.


La segunda parte es la anotación, la caracterización de los productos génicos utilizando términos de la ontología. Los miembros del Consorcio GO (GO Consortium en inglés) entregan su información y se hace libre en público a través del sitio GO.


GO es asimismo una parte de un esmero mayor de clasificación, las Ontologías Biomédicas Libres, (Open Biomedical Ontologies, OBO, en inglés).


La Ontología Génica fue originalmente construida en mil novecientos ochenta y ocho por un consorcio de estudiosos que estudiaban el genoma de 3 organismos modelo: Drosophila melanogaster (mosca del vinagre, o bien mosca de la fruta), el Mus musculus (ratón casero, o bien ratón de laboratorio), y el Saccharomyces cerevisiae (diastasa). Otras muchas bases de datos de organismos modelo se han unido al consorcio de la Ontología del Gen, contribuyendo tanto con la anotación de genes de uno o bien más organismos, como en el desarrollo de las ontologías. Cara enero de dos mil ocho, GO contiene sobre veinticuatro con quinientos términos aplicables a una extensa pluralidad de organismos biológicos. Hay un cuerpo de literatura significativo sobre el desarrollo y empleo de GO, y se ha transformado en una de las herramientas estándar en la bioinformática.


Cada término GO consiste en un solo identificador alfanumérico, un nombre común, sinónimos (si son de aplicación), y una definición. En el momento en que un término tiene múltiples significados en dependencia de las especies, el GO emplea una etiqueta "sensu" para distinguirlos entre ellos. Los términos son clasificados en solo una de las 3 ontologías, las que están estructuradas, cada una de ellas, como un grafo dirigido acíclico.


Nuevos términos y anotaciones son sugeridas por miembros de las comunidades de investigación y anotación. Una vez publicados, son revisados por miembros del consorcio GO para determinar su aplicabilidad.


Si se decide que un término de la ontología no es apropiado, es rechazado, o bien marcado como "obsoleto". Esto puede pasar por diferentes razones, como estar fuera del objetivo de la ontología o bien estar engañosamente nombrado o bien definido.


El fichero de la ontología está gratis libre en el sitio del GO; se puede buscar y navegar entre los términos utilizando el navegador GOAmiGO. El proyecto de Ontología del Gen asimismo provee mapeos de sus términos a otros sistemas de clasificación que cubren exactamente la misma área de la biología.


Un número de organizaciones, incluyendo las bases de datos de organismos modelo y de proteínas multiespecie, desarrollan análisis de secuencias de proteínas y produce tablas de asociaciones entre los presuntos productos génicos y los términos GO. Estas están gratis libres en el sitio del GO, y pueden ser bajadas individualmente o bien vistas online utilizando AmiGO.


En muchas bases de datos de secuencias genéticas viejas, las anotaciones cuentan con escasas, o bien ninguna, indicaciones sobre su procedencia, con lo que el usuario no puede de manera fácil revisar la naturaleza y fuerza de la patentiza que las respalda, lo que lleva a lo que es conocido en este campo como inconveniente de anotación transitiva. Ciertos genes son caracterizados por ensayos reales (wet lab), y su secuencia depositada en una base de datos primordial y pública con anotaciones de esos ensayos. Otras secuencias que no han sido caracterizadas en el laboratorio son anotadas conforme a su similaridad con aquella secuencia, y estas otras secuencias, a cambio, forman la base para siguientes anotaciones, y de este modo consecutivamente. De este modo, el usuario no puede saber cuántos pasos de semejanza entre secuencias hay entre las anotaciones de ciertas secuencias genéticas y cualquier dato de experimento real.


Una asociación GO tiene metainformación indicando:



  • Quién hizo la aseveración que un término Go aplica al supuesto producto de una secuencia protéica.
  • Cuando fue hecha esa aseveración.
  • Uno o bien más códigos de patentiza de 3 letras, indicando el género de patentiza en el que se fundamenta la aseveración.

Cualquier salida automática de un programa que no haya sido dirigida por un humano recibe el código de patentiza IEA, significando colegido de anotación electrónica (Inferred from Electronic Annotation, en Inglés). El empleo de un código diferente al del IEA implica que un supervisor humano ha comprobado esta anotación. Por poner un ejemplo, TAS (Traceable Author Statement, declaración de autor referenciable) quiere decir que un supervisor ha leído un paper científico publicado, y la metainformación para esa asociación cuenta con una cita o bien referencia a dicho paper. Por otro lado, ISS que significa deducido de semejanza de secuencia, quiere decir que un supervisor humano ha revisado el resultado de una busca de semejanza entre secuencias, y ha verificado que es biológicamente significativa.


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